MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 plasmid pXAUT01

Total Repeats: 6524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009717	TGA	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243669
2	NC_009717	CCG	2	6	612	617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243669
3	NC_009717	GGT	2	6	708	713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243669
4	NC_009717	AGG	2	6	796	801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243669
5	NC_009717	GTAC	2	8	818	825	25 %	25 %	25 %	25 %	154243669
6	NC_009717	CCG	2	6	901	906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243669
7	NC_009717	TCGATC	2	12	955	966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154243669
8	NC_009717	CGG	2	6	1039	1044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243669
9	NC_009717	TCG	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243669
10	NC_009717	TGATC	2	10	1109	1118	20 %	40 %	20 %	20 %	154243669
11	NC_009717	CGC	2	6	1156	1161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243669
12	NC_009717	TGA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243669
13	NC_009717	TCC	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243669
14	NC_009717	TCT	2	6	1310	1315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243669
15	NC_009717	GTG	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243669
16	NC_009717	G	7	7	1407	1413	0 %	0 %	100 %	0 %	154243669
17	NC_009717	GTC	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243669
18	NC_009717	CGGG	2	8	1592	1599	0 %	0 %	75 %	25 %	154243669
19	NC_009717	TGA	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243669
20	NC_009717	TCG	2	6	1766	1771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243670
21	NC_009717	CCG	2	6	1857	1862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243670
22	NC_009717	GCC	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243670
23	NC_009717	CGA	3	9	1954	1962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243670
24	NC_009717	AGA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154243670
25	NC_009717	GC	3	6	2116	2121	0 %	0 %	50 %	50 %	154243670
26	NC_009717	GGT	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243670
27	NC_009717	CGA	2	6	2140	2145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243670
28	NC_009717	CCGC	2	8	2178	2185	0 %	0 %	25 %	75 %	154243670
29	NC_009717	CGAG	2	8	2203	2210	25 %	0 %	50 %	25 %	154243670
30	NC_009717	GTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154243670
31	NC_009717	CAG	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243670
32	NC_009717	CAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243670
33	NC_009717	CAT	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243670
34	NC_009717	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243670
35	NC_009717	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243670
36	NC_009717	GAG	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243670
37	NC_009717	AGG	2	6	2691	2696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243670
38	NC_009717	ACG	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243671
39	NC_009717	GCG	2	6	2920	2925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243671
40	NC_009717	TGG	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243671
41	NC_009717	CGAC	2	8	3045	3052	25 %	0 %	25 %	50 %	154243671
42	NC_009717	CG	3	6	3053	3058	0 %	0 %	50 %	50 %	154243671
43	NC_009717	CCA	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243671
44	NC_009717	GAC	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243671
45	NC_009717	TCG	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243671
46	NC_009717	CG	3	6	3259	3264	0 %	0 %	50 %	50 %	154243671
47	NC_009717	CGG	2	6	3413	3418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243671
48	NC_009717	GAT	2	6	3430	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243671
49	NC_009717	GAA	2	6	3449	3454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154243671
50	NC_009717	ATT	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154243671
51	NC_009717	GGA	2	6	3595	3600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243671
52	NC_009717	A	6	6	3704	3709	100 %	0 %	0 %	0 %	154243671
53	NC_009717	GAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154243671
54	NC_009717	TAA	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154243671
55	NC_009717	CAT	2	6	3775	3780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243671
56	NC_009717	GCA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243671
57	NC_009717	CGGA	2	8	3965	3972	25 %	0 %	50 %	25 %	154243671
58	NC_009717	TCG	3	9	4118	4126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243671
59	NC_009717	TGA	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243671
60	NC_009717	GCC	2	6	4232	4237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243672
61	NC_009717	GCG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243672
62	NC_009717	TCG	2	6	4331	4336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243672
63	NC_009717	CGG	2	6	4341	4346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243672
64	NC_009717	GC	3	6	4361	4366	0 %	0 %	50 %	50 %	154243672
65	NC_009717	T	6	6	4384	4389	0 %	100 %	0 %	0 %	154243672
66	NC_009717	CGC	2	6	4413	4418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243672
67	NC_009717	CGG	2	6	4425	4430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243672
68	NC_009717	CGGT	2	8	4466	4473	0 %	25 %	50 %	25 %	154243672
69	NC_009717	CCTTG	2	10	4494	4503	0 %	40 %	20 %	40 %	154243672
70	NC_009717	CCA	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243672
71	NC_009717	CGACCT	2	12	4605	4616	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	154243672
72	NC_009717	ATC	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243672
73	NC_009717	CGA	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243672
74	NC_009717	GCG	2	6	4732	4737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243672
75	NC_009717	GCC	2	6	4741	4746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243672
76	NC_009717	AGC	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243672
77	NC_009717	GC	3	6	4791	4796	0 %	0 %	50 %	50 %	154243672
78	NC_009717	CTTC	2	8	4845	4852	0 %	50 %	0 %	50 %	154243672
79	NC_009717	CGGGG	2	10	4856	4865	0 %	0 %	80 %	20 %	154243672
80	NC_009717	CCGCG	2	10	4929	4938	0 %	0 %	40 %	60 %	154243672
81	NC_009717	GGC	2	6	5014	5019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243672
82	NC_009717	ACC	2	6	5051	5056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243672
83	NC_009717	G	6	6	5066	5071	0 %	0 %	100 %	0 %	154243672
84	NC_009717	GCC	2	6	5088	5093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243672
85	NC_009717	AGGGG	2	10	5215	5224	20 %	0 %	80 %	0 %	154243672
86	NC_009717	GCT	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243672
87	NC_009717	CCA	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243672
88	NC_009717	CAG	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243673
89	NC_009717	CG	3	6	5380	5385	0 %	0 %	50 %	50 %	154243673
90	NC_009717	GCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243673
91	NC_009717	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	154243673
92	NC_009717	CCT	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243673
93	NC_009717	CTG	2	6	5526	5531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243673
94	NC_009717	TCGACG	2	12	5542	5553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154243673
95	NC_009717	CGC	2	6	5586	5591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243673
96	NC_009717	GCG	2	6	5619	5624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243673
97	NC_009717	TTG	2	6	5641	5646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154243673
98	NC_009717	GAC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243673
99	NC_009717	TCG	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243673
100	NC_009717	CGA	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243673
101	NC_009717	GCC	2	6	5756	5761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243674
102	NC_009717	GCC	2	6	5775	5780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243674
103	NC_009717	GCC	2	6	5895	5900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243674
104	NC_009717	GCT	2	6	5902	5907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243674
105	NC_009717	TCA	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243674
106	NC_009717	CTC	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243674
107	NC_009717	ATG	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243674
108	NC_009717	CG	3	6	6061	6066	0 %	0 %	50 %	50 %	154243674
109	NC_009717	GCA	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243674
110	NC_009717	GAA	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154243674
111	NC_009717	CGA	2	6	6171	6176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243674
112	NC_009717	GCG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243674
113	NC_009717	TGC	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243674
114	NC_009717	TCG	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243674
115	NC_009717	GC	3	6	6389	6394	0 %	0 %	50 %	50 %	154243674
116	NC_009717	CG	3	6	6402	6407	0 %	0 %	50 %	50 %	154243674
117	NC_009717	GCG	2	6	6423	6428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243674
118	NC_009717	GCT	2	6	6465	6470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243674
119	NC_009717	GTC	2	6	6471	6476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243674
120	NC_009717	GTCGC	2	10	6485	6494	0 %	20 %	40 %	40 %	154243674
121	NC_009717	CAC	2	6	7729	7734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243675
122	NC_009717	GC	3	6	7747	7752	0 %	0 %	50 %	50 %	154243675
123	NC_009717	GAG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243675
124	NC_009717	GCC	2	6	7781	7786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243675
125	NC_009717	GCC	2	6	7791	7796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243675
126	NC_009717	GCG	2	6	7835	7840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243675
127	NC_009717	GGCGAT	2	12	7867	7878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154243675
128	NC_009717	TCA	2	6	7893	7898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243675
129	NC_009717	CGGG	2	8	7908	7915	0 %	0 %	75 %	25 %	154243675
130	NC_009717	TCCGCC	2	12	7940	7951	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	154243675
131	NC_009717	GC	3	6	7979	7984	0 %	0 %	50 %	50 %	154243675
132	NC_009717	CCA	2	6	8012	8017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243675
133	NC_009717	CAC	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243675
134	NC_009717	GTC	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243675
135	NC_009717	TGC	2	6	8051	8056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243675
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138	NC_009717	GCG	3	9	8138	8146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243675
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141	NC_009717	GCC	2	6	8210	8215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243675
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143	NC_009717	AGCG	2	8	8330	8337	25 %	0 %	50 %	25 %	154243675
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254	NC_009717	GAT	2	6	13015	13020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243681
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262	NC_009717	CTC	2	6	13946	13951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243682
263	NC_009717	TGA	3	9	13969	13977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243682
264	NC_009717	GGC	2	6	14002	14007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243682
265	NC_009717	GC	3	6	14018	14023	0 %	0 %	50 %	50 %	154243682
266	NC_009717	CGC	2	6	14068	14073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243682
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270	NC_009717	TTC	2	6	14232	14237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243682
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285	NC_009717	GGT	2	6	14993	14998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243683
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